जिबूती हॉर्न प्रायद्वीप में स्थित है, जिसकी उत्तरी सीमा एरित्रीया से, पश्चिम और दक्षिण में इथियोपिया से, और दक्षिण-पूर्व में सोमालीलैंड से लगती है। पूर्व में एडेन की खाड़ी है। देश को तीन क्षेत्रों में विभाजित किया जा सकता है; देश के मध्य और दक्षिणी भागों में तटीय मैदान और ज्वालामुखी पठार, और उत्तर में पर्वत श्रृंखलाएँ। देश का अधिकांश भाग बंजर भूमि है जिसमें लगभग कोई कृषियोग्य भूमि नहीं है।