Джибуті знаходиться на півострові Ріг, межує з Еритреєю на півночі, Ефіопією на заході та півдні, і Сомалілендом на південному сході. Затока Аден лежить на сході. Країну можна розділити на три регіони: прибережну рівнину та вулканічні плато в центральній та південній частинах країни та гірські хребти на півночі. Більша частина країни є пустелею з практично відсутньою орною землею.